DNA是最常用的核酸探针，指 长度在几百碱基对以上的双链DNA或单链DNA探针。现已获得DNA探针数量很多，有xx、病毒、原虫、xx、动物和人类细胞DNA探针。这类探针多为某 一基因的全部或部分序列，或某一非编码序列。这些DNA片段须是特异的，如xx的毒力因子基因探针和人类Alu探针。这些DNA探针的获得有赖于分子克隆 技术的发展和应用。以xx为例，目前分子杂交技术用于xx的分类和菌种鉴定比之G+C百分比值要准确的多，是xx分类学的一个发展方向。加之分子杂交技术 的高敏感性，分子杂交在临床微生物诊断上具有广阔的前景。xx的基因组大小约5×106bp，约含3000个基因。各种xx之间绝大部分DNA是相同的， 要获得某xx特异的核酸探针，通常要采取建立xx基因组DNA文库的办法，即将xxDNA切成小片段后分别克隆得到包含基因组的全信息的克隆库。然后用多 种其它菌种的DNA作探针来筛选，产生杂交信号的克隆被剔除，{zh1}剩下的不与任何其它xx杂交的克隆则可能含有该xx特异性DNA片段。将此重组质粒标记 后作探针进一步鉴定，亦可经DNA序列分析鉴定其基因来源和功能。因此要得到一种特异性DNA探针，常常是比较繁琐的。探针DNA克隆的筛选也可采用血清 学方法，所不同的是所建DNA文库为可表达性，克隆菌落或噬斑经裂解后释放出表达抗原，然后用来源xx的多克隆抗血清筛选阳性克隆，所得到多个阳性克隆再 经其它xx的抗血清筛选，{zh1}只与本xx抗血清反应的表达克隆即含有此xx的特异性基因片段，它所编码的蛋白是该菌种所特有的。用这种表达文库筛选得到的 显然只是特定基因探针。
　　对于基因探针的克隆尚有更快捷的途径。这也是许多重要蛋白质的编码基因的克隆方法。该方法的{dy}步是分离纯化蛋白质， 然后测定该蛋白的氨基或羟基末端的部分氨基酸序列，然后根据这一序列合成一套寡核苷酸探针。用此探针在DNA文库中筛选，阳性克隆即是目标蛋白的编码基 因。值得一提的是真核细胞和原核细胞DNA组织有所不同。真核基因中含有非编码的内含子序列，而原核则没有。因此，真核基因组DNA探针用于检测基因表达 时杂交效率要明显低于cDNA探针。 DNA探针（包括cDNA探针）的主要优点有下面三点：①这类探针多克隆在质粒载体中，可以无限繁殖，取之不尽，制备方法简便。②DNA探针不易降解（相 对RNA而言），一般能有效抑制DNA酶活性。③DNA探针的标记方法较成熟，有多种方法可供选择，如缺口平移，随机引物法，PCR标记法等，能用于同位 素和非同位素标记.
　　DNA探针可以用来诊断寄生虫病，现场调查及虫种鉴定，可用于病毒性肝炎的诊断，遗传性疾病的诊断，可用于改造变异的 基因，可用于检测饮用水病毒含量。具体方法：用一个特定的DNA片段制成探针，与被测的病毒DNA杂交，从而把病毒检测出来。与传统方法相比具有快速、灵 敏的特点。传统的检测一次，需几天或几个星期的时间，xx度不高，而用DNA探针只需{yt}。据报道，能从1t水中检测出 10个病毒来，xx度大大提高。