液体菌种以其纯度高，活力强，萌发快，抑制污染等优势，逐渐取代固体菌种而成为菌种生产的主流，在食用菌生产中将会广泛推广普及，提出应用中应注意的几个问题供参考：

       一、 注意培养基含水量的变化

       食用菌栽培的培养基，因接入液体菌种营养液浸润到培养基中，会提高培养器的含水量，制作栽培袋时，如果培养基含水量偏高，再加接入的营养液，培养基就会因含水量过高而抑制菌球萌发后的吃料和生长。
       二、 培养基透气性要好
       使用液体菌种栽培，食用菌养菌速度加快了，但栽培食用菌的培养基透气性很重要，否则会因液体菌种的营养液粘度较高，接到培养基内更加抑制透气性。因此，栽培原料不能过细，装袋不能过紧。要注意提高培养基透气性，促进养菌速度。
       三、 接种时机要把握好
       当液体菌种菌球生长1毫米，密度达到80%以上时，为适宜接种时机，过早菌球浓度过低，过晚菌球老化、有破裂，都会影响菌种的萌发和定植。
       四、 接种量要适中
       17ⅹ33的袋，菌种一般每袋接入5—20毫升，菌球萌发速度快的品种如：平菇、鸡腿菇接种量可偏少些，萌发速度慢的菌种如木耳、白灵菇等，接种量可偏多点。接种量过少，萌发慢，封住料面慢，菌球易吊干甚至不萌发、不吃料。接种量过大，培养基表面堆积大量菌球，浸入大量营养液，致使透气性降低，影响菌种萌发和生长，反而易造成污染。
       五、 接种面分布要均匀
       接种枪在接种时要对着接种面转动，以使菌球均匀散布于料面，否则，菌球堆积部位和没有菌球的部位都长不好。
       六、 接种后的培养温度要适宜
       接种后5天内，养菌温度不可过低，一般不低于20℃，否则菌球迟迟不萌发，液体菌种的优势就没有了，过几天温度即使再上升，杂菌已侵入，由于料面的营养液而快速生长造成污染，而菌种的菌球或吊干，或因自身营养枯竭而死，难以萌发生长。