基于RRLC-MS/MS方法的乳腺癌尿液代谢组学研究基于RRLC-MS/MS方法的乳腺癌尿液代谢组学研究
陈艳华1,张瑞萍1,白进发1,宋咏梅2,再帕尔·阿不力孜1

代谢组学与基因组学,转录组学或蛋白质组学相比,能够通过分析生物体体液和组织中小
分子代谢物的变化,研究机体整体生物学状况和功能调节,更有利于疾病的早期预警,早期诊
断,预后预测以及指导制定个体化xx方案等.[1]
本研究以尿液为研究对象,利用快速高分辨液相色谱系统(RRLC)与质谱联用的技术,
以"互补性"分析思路为指导,结合正,负离子检测模式下的增强型全扫描(EMS)谱,获
取尿液中尽可能全面的内源性小分子代谢物信息.目前采集了20例乳腺癌患者和18例正常人
的晨尿,经过离心稀释后,分别进行正,负离子检测模式的RRLC-MS谱分析.将RRLC-MS
谱结果导入统计xxxxMarkerview中,同时进行峰对齐,峰匹配和峰强度校正.经过修正
的PCAxx离群样本点,尺度差异的影响后,获得了较好的分类效果.如图1所示,在得分
图中的{dy}主成分PC1上可将健康人和乳腺癌患者区分(实心点为健康人,空心点为乳腺癌
患者);在其载荷图上寻找对正常人与乳腺癌患者分类贡献大的小分子代谢物,这些代谢物有
可能为生物标志物.图2是由负离子检测模式的RRLC-MS谱获得的结果.目前,在正离子检
测模式下寻找到的可能标志物有43个,负离子模式下有25个,并采用RRLC-MS/MS技术,
结合网上代谢物数据库检索,已鉴定出14种代谢物的结构.其中有2个是文献已报道的癌症
标志物,其余12种还未见相关文献报道.
图1由正离子检测模式的RRLC-MS谱获得的PCA分析得分图(a)及载荷图(b)
图2由负离子检测模式的RRLC-MS谱获得的PCA分析得分图(a)及载荷图(b)
参考文献:
[1]Katja Dettmer, Pavel A. Aronov,Bruce D. Hammock.Mass Spectrometry Reviews,2007, 26, 51-78.

来源