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DnaSP 4.10.9 基因多态性xxxx。
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Sequencher 4.8 序列拼接软件。
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ConsInspector 3.3 DNA蛋白结合位点预测识别软件。
GenomePixelizer 2003.10.1版 帮助理解基因组中的簇基因（clustering gene）之间的相互关系的软件。
Gene Construction Kit 2.5 Demo 管理并显示克隆策略中的分子构建过程软件。
GenescanView 1.2 查看基因扫描（genescan）格式.fsa文件的小软件。
Sequin 7.77 数据库GenBank, EMBL, DDBJ 查询软件。
DNAuser 1.0 DNA序列处理软件。
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GenomeComp 1.3 中科院生物物理所生物信息实验室推出的可视化的微生物基因组比较工具
Apollo 1.6.5 Java语言开发的基因组注释显示编辑软件
SNPHunter 1.75 SNP（单核苷酸多态性）查找软件。
SSRHunter 1.3 SSR（Simple Sequence Repeat，即简单序列重复，又称微卫星DNA）位点查找软件。
iCE 3.5 Java语言编写的显示基因指纹图及相关数据的软件
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Sequence Scanner v1.0 显示分析ABI基因分析仪DNA图谱数据软件，
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WinGene 2.31 分析核酸序列的多用工具软件；
BioLign 4.0.6 还增加免费序列拼接软件；
PIC_Calc 0.6 多态信息含量计算程序。
SequenceViewer 1.0 DNA序列图形显示软件；
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TreeView 1.6.6 进化树处理软件。
GeneTree 1.3 比较基因与种系进化树的程序。
NDE 0.5.0 用来编辑NEXUS格式文件的程序。
TreeMap 1.0 用来可视地比较主、从进化树的程序。
Spectrum 分析进化信息而不用将之转化为进化树的软件。
Phyltools 1.32 计算与处理进化树数据的软件。
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ATV 1.92 JAVA语言编写的显示"New Hampshire"与NHX格式的进化树文件软件。
TREECON 1.3b Demo 构建和绘制进化树的软件包。
ProBiosys 0.9 比较表现型分类法数据和分析计算核酸序列数据距离值的软件。
COMPONENT 2.0 分析进化树免费软件。
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PAUP 4 PAUP的快速使用手册
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Vanilla 1.2 使用PAL编写的进化分析命令行程序；
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T-REX 4.01 进化树构建xxxx；
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TREEFINDER 200706版 计算进化xxxx
PHASE 2.0 序列进化xxxx；
BAMBE 2.01b 分子生物进化xxxx；
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MTgui 1.5 MODELTEST图形操作介面软件
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BEAST 1.4.6 贝叶斯进化xxxx
MESA 1.9.23 宏进化分析和模拟软件；
TreeJuxtaposer 2.1 进化树比较xxxx；
TreeExplorer 2.12 进化树绘制显示软件；
TreeMe 03/2007 进化树生成和显示软件；
DNATREE 1.2 DNA序列进化xxxx
Genie 3.0 系谱间隔xxxx
Pebble v1.0 进化xxxx；
ArboDraw 进化树绘图软件
PhyloDraw 0.82 进化树绘图软件.
MrBayes 3.1.2 进化树xxxx；
Network 4.201 进化树生成软件；
PhyDE 0.993 进化数据编辑器；
PRAP 1.21 Parsimony ratchetxxxx
图像处理
Image Tool 3.0 科学用途的处理图像软件。
Image J 1.38 用Java语言写成的科学用途的处理图像软件。
Cross Checker 2.91 基因指纹图xxxx。
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ALFmap 1.22 ALF (Amersham Pharmacia) 图像格式转换软件。
Band Leader 3.0 凝胶图像处理软件。
Scion Image 4.03 图像处理与分析工具。
OSIRIS 4.19 通用医学图像处理与xxxx。
Melanie Viewer 6.0 免费Melanie图像查看器。
TotalLab v2006c 评估版 图像xxxx。
LabImage 2.71 评估版 凝胶图像xxxx。
QuantiScan 3.0 Demo 使用简单功能专一的凝胶扫描、xxxx。
Engauge Digitizer 4.1 图形数字化软件。可以将曲线图转化为数据与等式。
Graph Digitizer version 2.16 图形数字化软件。
Peak Explorer 2.11 处理试验图谱图像软件。
电泳图谱绘制器1.0 处理电泳图谱图像软件。
Volocity LE 4.2.1 免费显微图像处理软件。
GetData 2.22 图像数字化处理软件。
Bersoft Image Measurement 5.1 图像数字化处理软件。
DigitizeIt 1.5 图像数字化处理软件。
CellC v1.11 微生物显微图像处理软件
QNX6.3
GPSS Persional 5.2.0 仿真xxxx
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SIEMENS INSIGHT3.9 DDC
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