近两年来，受金融危机因素影响，个别行业市场出现阶段性萎缩、低糜，而食用菌行业却成为很多投资者关注的焦点，吸引了一些投资者转入食用菌行业，从菌种、机械设备、产品生产，到销售、加工，甚至出口，都有新生的力量在不断加入。尤其是一些基地县和一些xxxx更是群策群力，从政策措施、设施建设、人才配备等强化食用菌产业的地位、作用，甚至有些主产基地把农业转型的重担压在了一朵小蘑菇上了。如今，小蘑菇在农村经济中成为一个大产业。一年来，食用菌也为主产地实现农民就地就业，发展绿色产业作出了应有贡献。而加入食用菌行业的各种设备生产企业，更是良莠不齐，有些企业甚至就是一根焊条加一把钳子就干上简单的食用菌生产设备。
而行业声音最为响亮的是2009年2月25日，李树萍会长在中国食用菌协会四届四次会议的讲话：强调食用菌行业的发展，必须积极争取地方各级政府的支持。在中央连续多年的一号文件下，各级政府也在关注这个微生物产业、朝阳产业，食用菌成为了农村经济工作中的一个新亮点。2009年，各级领导纷纷踏访食用菌生产大棚、基地，xxx总书记2009年10月17日深入芳绿公司考察，又一次和食用菌科技工作者握手，号召大家要科技创新，全面提升食用菌产业的质量和效益，全力推动食用菌产业又好又快发展。一年中，还有各种会议、论坛，还有各级领导对行业的考察、视察，《食品安全法》也顺利出台了。一时间，产业和协会、政府靠得更近了，发展也更快了。千年蕈菌在中国爆发出了强大的生命力。绿色农业、有机农业、食药两用农业、创汇农业，成为食用菌头上的美丽光环。
食品安全问题由来以久，添加剂超标、农残留物过量、以次充好等问题时有发生，给消费者的安全健康带来了威胁，产业形象也受到了损害。尤其是一些国家的“绿色壁垒”，使我国的出口受到了严重影响。对于食品安全的问题，全国人们高度重视，不断要求食品行业自律，国家也曾计划成立国家食品安全委员会，由国务院来协调相关各部委共同管好食品。众望所归，在《食品卫生法》的基础上修订，于2009年6月1日，国家正式出台了《食品安全法》，这是我国食品产业发展过程中的里程碑，对我国的绿色产业发展、农业的发展和食品业的发展有重要的作用。
无害化是基础。食品安全首先在于食品的无害化，即适量、合理使用添加剂，不使用或少使用农药，变质产品严禁上市，过期食品坚决取缔。而行业的发展更在于产品绿色、有机、营养，有机化才是产业发展的动力。在食用菌行业发展过程中，如何使庭院式的蘑菇栽培符合绿色健康的要求？笔者认为，一是在于环境，二是在于人的管理及道德素质、法律意识。而后一点是最重要的。只要具备了后一点，只要有较好的环境，就能生产出绿色、有机产品。而要大规模、周年性生产，则只有借助厂房，规范化标准化规模生产。
近年来，由于食用菌餐饮的快速发展和人们群众生活的提高，蘑菇消费日益增多，而且是越发达地区、国家，人均蘑菇消费水平越高。对于发展中的我国，蘑菇的消费潜力巨大。如何生产出足够多、能出口的蘑菇是食用菌行业前进的方向；如何使我国蘑菇的xxx达到{zy}、最有竞争力，是我们行业迎头赶上的关键。在借鉴国际先进的生产方式时，结合我国特有的各类优势资源，一种适应我国国情的食用菌的工厂化生产渐成雏形。有人说，工厂化生产是现代集成技术工程应用，有人说工厂化生产就是要能实现周年出菇。现在，我国主要的模式有“灌南模式”“梁山模式”，以及抓两头、放中间的洋为中用模式。究竟哪种模式适合工厂化生产，笔者认为不同地域、不同条件，肯定会有不同要求，而且大生产式的工厂化生产肯定会取代手工作坊式生产。
现在不是小农经济时代，进入资本的大生产时期。不要说国际方面的“壁垒”，就是生产要素、流通领域、市场自律整合，都需要一个综合抗衡的力量。各家自扫门前雪，{zh1}大家都出不了门。政府、基地、协会、xxxx等召唤大家“抱团”，减少各自为战，被各个击破的命运，于是出现了一种新型组织——新时期合作化组织。近年来，合作化愈演愈烈。在食用菌行业主要有三种形式：“公司+基地+农户”“合作社+农户”“协会+合作社+农户”。
“公司+基地+农户”，这种形式，一般为xxxx所采用。xxxx拥有足够的资金、先进的技术，以及广大市场的开拓能力。他们掌握xxx的市场信息，能够准确引导菇民的种植方向。xxxx还可以把握好前期的生产管理，尤其是菌种的制作、生产和管理，把风险降低。而菇民可以在基地或自家种菇，只管理好菇的生产和采收，这样便于把一个工艺做精，从而提高产品质量。这种方式适合大规模的公司运作，有强大的支配国内、甚至国际的作用。
