同济大学交通运输工程学院城市轨道与铁道工程系的前身可追溯至 1952年同济大学创建的铁道工程专业和1958年上海铁道学院创办的铁道建筑系。在1973年院系调整中将同济大学铁道工程专业调整到了上海铁道学院（1995年改为上海铁道大学）铁道工程系。2000年4月上海铁道大学与同济大学合并，铁道建筑工程系进入同济大学土木工程学院，2003年10月由于学科建设的需要，该系进入同济大学交通运输工程学院，并将系名改为城市轨道与铁道工程系。铁道工程学科是我国恢复招生考试后国家学位委员会首批授予的硕士学位点之一,现可招收道路与铁道工程专业的硕士生和博士生。

　　城市轨道与铁道工程系目前设有铁路路基、铁路轨道结构、铁路轨道管理、城市轨道交通规划与设计、铁路隧道等 5个研究室和铁道工程实验室。本系现有教职工34人，其中教授6人，副教授等副高级职称11人，其中博士生导师4人，硕士生导师10人。在教学方面，主要承担土木工程专业轨道交通工程方向的本科生教学和道路与铁道工程学科铁道工程、城市轨道交通工程二个方向的研究生教学任务。长期以来，为我国铁路与城市轨道交通工程领域培养了大批高级技术人才。近年来，出版专著、教材十余部，其中由王午生教授主编的上海市普通高校“九五”重点教材“铁道线路工程”，先后获得了铁道部优秀教材一等奖和上海市优秀教材二等奖。

　　城市轨道与铁道工程系科学研究工作比较活跃，近年来年均科研经费达 300多万元。2000年以来，主要承担了高速磁浮交通、高速铁路、既有铁路提速、城市轨道交通等领域多项比较重大的科研任务，其中有国家863计划项目2项，铁道部重大科技项目4项，获得吉林省科技进步二等奖1项和山东省科技进步三等奖1项。

　　我国高速铁路与城市轨道交通将要跨入高速发展的阶段，可以相信，城市轨道与铁道工程系必将过自身的不断努力，为我国铁路与城市轨道交通领域的教育、科技和建设事业作出更大的贡献