1945年，美国相继在日本广岛、长崎投下原子弹，中华民国总统蒋介石萌发出制造原子弹的雄心。1946年6月，国民党政府悄悄成立了“原子能研究委员会”。并军政部派遣青年科学家到美国学习{zx1}的原子物理科技，学成回国再参与原子弹计划。尔后，国共战局愈来愈不利于国民党，{zh1}被迫退守台湾，军政部派遣赴美留学的那批青年科学家，在兵荒马乱的战争年代也星散海内外。但蒋介石依然不忘核武研制。在这种背景下， 1949年，唐君铂辞职赴美深造，专攻火箭研制技术。1956年4月回台湾后任“国防部”常务次长，1958年参与军事科技工作，成为台湾主要火箭科技专家之一，并兼任“总统府”顾问。

但1964年10月大陆{dy}颗原子弹试爆成功，使台当局极为震惊。蒋介石下决心发展军事科研，成立“石门科学研究院筹备处”，唐君铂出任筹备主任。1965年7月1日，筹备处从台北市区搬到“石门营区”，全称也改为“中山科学研究院筹备处”。1969年7月1日，“中山科学研究院筹备处”正式改名为“中山科学研究院”，唐君铂任副院长，是技术方面的具体负责人，多次前往各国，秘密高薪遴聘高级顾问，低调住进“中科院”的外籍人员官舍，协助原子弹研发。

1975年，蒋介石去世。而后几年，美国为推动与大陆关系正常化，从尼克松政府时期逐步调整原先暗助与放任台湾发展核武的政策。1978年，由4名美国核武技术专家组成的一个工作小组飞抵台北。这群美国专家由美国驻台北“大使馆”掌管情报的领事李文带领，浩浩荡荡驱车前往“中山科学院”核能研究所，强行拆除神秘的“新新计划”设施（包括核子装备及一批已精炼完成的浓缩铀）。唐君铂呕心沥血十余年的台湾火箭事业毁于一旦。

1981年，唐君铂选为中国国民党“中委”委员、候补委员，“国防部”供应司令部中将司令。1988年7月，被聘为“中央评议会”委员等。