来源: 北京软件开发公司
（1）工厂本身尚未有完整的制度，人员流动性大，组织变更也大，前者定的规格，制作完成后，变更负责人员，其规格也随之改变。
（2）MES在国内研发才刚起步，各制造业尚缺乏成功的范例，也缺少专业的实施公司，对其没有正确的观念与认识，推行信心及决心不够。
（3）工厂性质多属少量多样，订单式生产型态，生产现场多混乱，经常有例外状况，作业上较难配合。
（4）要达到实时xx的监控管理功能，须现场作业人员充份的配合，一般而言，作业人员忙于生产，较难要求其确实输入数据。而一般MIS或ERP系统多是on-line批次作业，而非 Real-time 作业，执行上较具弹性。
（5） MES 现场{dy}线管理者（如组长）可能难以正确理解MES导入的意义，反而因透明化使权力有被剥夺的感觉。
（6）一般人习惯于用笔记录，较不习惯Paperless 电子化作业。
（7）因MES 强调 real-time数据收集、监督及控制较诸一般数据处理的应用系统，其技术难度较高，须有专业计算机系统技术经验者才足以胜任。对使用者而言，此系统包含现场实时作业的软件、硬件，维护上也较困难些。
MES的应用，要充分考虑到企业的具体情况，以谋求最合适的信息化解决方案。
企业的生产方式，主要可以分为按定单生产、按库存生产或上述两者的组合。从生产类型上考虑，则可以分为批量生产和单件小批生产。从产品类型和生产工艺组织方式上，企业的行业类型可分为流程生产行业和离散制造行业。无论从功能模型还是信息模型以及相关技术上，都覆盖了流程生产行业和离散制造行业。但是，无论从工艺流程还是生产组织方式方面，流程生产行业和离散制造行业都存在较大的差别。所以，在MES具体实施上，要根据行业特征区别对待。
行业的需求差异
流程生产行业，主要是通过对原材料进行混合、分离、粉碎、加热等物理或化学方法，使原材料增值。通常，他们以批量或连续的方式进行生产。而离散工业主要是通过对原材料物理形状的改变、组装，成为产品，使其增值。在MES需求、应用环境等诸多方面，两者都有较大的差异。
产品结构工艺流程、自动化水平、生产计划管理、设备、批号管理和跟踪
流程生产行业的生产工艺过程中，会产生各种协产品、副产品、废品、回流物等，对物资的管理需要有严格的批号。例如，制药业中的药品生产过程要求有十分严格的批号记录和跟踪，从原材料、供应商、中间品以及销售给用户的产品，都需要记录。一旦出现问题，企业要可以通过批号反查出是谁的原料、哪个部门、何时生产的，直到查出问题所在。而离散制造业一般对这种要求并不十分强调，虽然现在很多离散制造业企业也在逐渐完善批号跟踪管理。
制造执行系统MES是为使上至管理阶层，下至生产单位（车间、班次），能充分掌握作业现场信息，有效地控管生产流程而设计的。就整体而言，使整个公司的生产效率提升，缩短制造的前置时间，提供快速响应供应链体系变动的后盾。
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