MIDAS Workflow--生物标志物验证与确认技术平台- 液相色谱柱法的日志 ...

MIDAS Workflow--生物标志物验证与确认技术平台

2010-04-02 11:17:59 阅读12 评论0 字号:


  
 Applied Biosystems

 

      其它各类技术方法(包括蛋白质组学相关技术,基因组学相关技术,各类已发表文献等)鉴定的具有潜在生物体标志物性质的蛋白质或基因,只需知道该分子的基因序列或氨基酸序列,就可应用MIDAS方法进行大批量样本的分子验证与确认工作。其主要工作模式如下:将分子的基因或氨基酸序列输入MIDAS Designer软件的序列框,设定相关参数后,软件自动构建MRM扫描模式所需要的母/子离子对的排列。而后,3200 QTRAP或4000 QTRAP质谱仪通过MRM扫描模式对大批量的样本监测是否有此母/子离子对排列的出现。如若信号出现,证明此分子在样本中存在,仪器将自动切换至MS/MS扫描模式,确定此母离子的碎片离子信息,并再次鉴定并确认该分子的结构。如若在MRM扫描工作中,未发现预期的母/子离子对出现,说明该分子在此样本中不存在。由于MRM扫描模式高效快速,且具有极高灵敏度,因此非常适合于高通量验证与确认生物标志物。



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