荧光原位杂交(FISH)探针详谈

ALL多探针诊断系统

创新设计 {lx1}技术
• 检测包括MLL基因的易位,儿科85%的ALL都有这种易位。
• 检测(ETV6)/AML1,21%的儿科病例中都有这种缺失。
• 检测30%的ALL病例中都有的非整倍体。添加的染色体的数量和同一性具有巨大的预后价值。
• E2A 探针t(1,19),检测20%的常规检测不能检测的病人。
• IGH 和 MYC鉴别像ALL的伯基特淋巴瘤病人
• 在同一张玻片上快速测定
• 价格优惠

英国Cytocell公司生产的ALL多探针诊断系统,专门为急性淋巴细胞白血病ALL设计的,在一张玻片上同时使用 8种不同的FISH探针,从而可以做到做一次杂交试验而尽可能多地提供病人的基因型信息。

探针1:MYC

8p 染色体的MYC 致癌基因的易位有许多断裂点,但为了能分别阻断而不管易位的存在,多探针诊断系统提供的探针组分别探测的区域很大(717Kb)。最接近的探针(177Kb)是332Kb 3'基因,标记为红色。而最远端的探针(188Kb)是380Kb 5'基因,标记为绿色。正常病人显示为融合或红绿信号密集地并排(2Y),同时,基因的重排检测为分开的绿色和红色信号(1Y,1G,1R)。和分离细胞一样,这个探针组可在间期细胞中检测 MYC的重排。

MYC阴性标本实例

探针2:P16
9p2 染色体缺失牵涉多种肿瘤,包括大约 10%的P16 缺失的儿科 ALL 病人。为了诊断这些缺失,ALL 多探针检测系统含一支这样的探针:标记为红色,覆盖区域为 9p21 101Kb区域,从P16 3' 59Kb
延伸到 P15的 5'端。探针组还包含一支9号染色体质控探针(D9Z3,9q12上异染色质的阻断),标记为绿色。正常细胞中,探针和质控在两者的同系物会显示有2个红色和2个绿色信号(2R,2G)。检测细胞会显示:1个红色信号和2个绿色质控(1R,2G),表明如果缺失为半合子,P16从1条染色体中丢失;或者是没有红色信号和两个绿色信号(0R,2G),表明是纯合子缺失。

P16阴性标本实例

探针3:E2A/MLL
E2A 的重排在 ALL病例中相对普通,有两种类型(t (1:19) 和 t (17;19)),占病人数量的 6%。经由 FISH检测到 E2A相关的t(1:19)融合,用标准的细胞遗传学检测存在20-25%患者遗漏。两个分裂探针由1支绿色的 3’探针和1支红色的 5’探针构成,基因的缺失将导致黄色或接近的红/绿的信号发生
分离,变成单独的红色和绿色。
因而,1个正常的细胞有两个融合信号(黄色)。如果 E2A基因因为易位而重排,一支黄色分裂探针分裂成红色和绿色,分别代表重排基因和染色体配偶体。这些病人的信号是3Y、1R、1G。

E2A/MLL阴性标本实例

探针4:

阴性标本实例

探针5:TEL/AML1

这种重排在儿童期B-ALL病例中最普通,使用FISH技术检测到大约21%病例中都有。Cytocell的FISH探针是双色双融合探针,阳性细胞有两个黄色信号。
ETV6 (TEL)探针包含一支含ETV6 5’终点的探针和一支覆盖基因3’区的探针,都标记为红色。对于AML,两支探针都标记为绿色,一支位于RUNX1 3',另一支在基因的5'末端。t(12:21)的病人,除了相应的12和21号正常染色体的红色和绿色信号,会有两个(黄色)融合信号(1R,1G,2Y)。有ETV6有大量缺失的地方,t(12;21)缺失的信号是1R、2G;或者是,存在t(12;21)重排的信号是1Y、1G。

TEL/AML1阴性标本实例

探针6:M LL

在染色体区带11q23的MLL基因的重排,可以在大约 85%的患B-ALL的婴儿中发现。这支分裂探针由一支绿色5’探针和一支红色3’探针组成,所以基因的破裂会形成1个黄色或紧密相连的红色/绿色信号分裂成独立的红色和绿色信号。在正常的细胞中,会有2个融合信号(黄色)。
如果MLL基因因为易位而重排,一支黄色分裂探针分裂成红色和绿色,分别代表重排基因和染色体配偶体。这些病人的信号是1Y,1R,1G。

MLL阴性标本实例

探针7:BCR/ABL

典型的立体易位t(9;22)在CML中最普遍,但在大约25% 的成人ALL和2-10% 的小儿ALL也有。BCR基因中有两个断裂点簇,较小和较大的断裂簇分别为mBCR和MBCR。ALL几乎大部分是由于断裂点引起的,包括mBCR。在少量的ALL病例中,因为与其它染色体的相互作用,易位不会导致细胞遗传学可见的Philadelphia染色体。在这些病例中,FISH对于突出融合基因很重要。

诊断系统中的BCR探针是双融合探针,包含两支BCR 探针,一支标测 BCR 3',第二支覆盖了基因5'56Kb的区域。两支都标记为红色并定位,所以断裂点在mBCR或者MBCR都可以导致融合信号。ABL探针毗邻群从FUB3 基因中部到离ABL 5'终点64Kb的位点,覆盖了349Kb。

在正常细胞中,这些探针显示红色和绿色信号,对应各自的同系物(结果形成了2G 2R的构象)。t(9:22)病人,会有两个融合信号(黄色),加上对应的22号和 9号正常染色体的红色和绿色信号(1R 1G 2Y)。

BCR/ABL阴性标本实例

探针8:IGH

t(8:14)易位最显著的结果涉及到MYC原癌基因的重排。然而,在T-ALL中最常见到是IgH基因的非普遍性重排,在B-ALL中也可见到。IGH 基因内所有这些重排有断裂点,Cytocell的 ALL多探针诊断系统中有一支IGH分裂探针,可以检测到一些重排,包括固定和变异段之间区域的 IGH基因分裂,从而鉴别基因中比较少见的重排的IGH易位配偶体染色体。
正常细胞会有2个融合信号(黄色)。IGH上有重排,其中一个黄色信号会分裂成红色或黄色(1Y,1R,1G)。

IGH阴性标本实例




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