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蛋白质组学的发展与挑战:,"动态和差异"是蛋白质组学研究的灵魂

2010-02-04 01:17:56 阅读8 评论0 字号:

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从研究策略上来说,SELDI的一大好处就是可以在你还没有进行昂贵费时的质谱或双向电泳等检测之前,就能够非常容易地、非常迅速地从几百个或上千个病例中间给出一个能够提供信心的判断,来表明这个改变在很多病人中是普遍存在的,有代表性的以及是可信的。然后可以很放心地再投入人力物力和时间去做更深入的研究。所以SELDI技术对于做biomarker的科研人员来说提供了一个深入研究的基础,可以事半功倍。尤其值得指出的是, biomarker并不xx于疾病,同样可用于其他许多生命科学的研究中。生命活动本质上就是一个精密调控的动态过程。在分析和研究任何一个生命过程时,都可以找到与这些生命过程及其各个阶段相关的一些biomarker,这对于理解和干预生命过程都是很有价值的。在进行这些更具基础研究色彩的,涉及作用机制的研究时,会需要很多价格昂贵或更专一的设备,任何单独一种技术和仪器是不够的, SELDI常常可以作为这些研究时起始的一个步骤,比较快地分析或者找到比较可靠的差异蛋白作为入手,以后可以借助其他的设备再对这些差异蛋白进行深入研究,科研人员就可以结合他们自己的实际,在自己想要研究的方向迈出比较可靠的{dy}步。

生物谷(Bioon.com):您能否预测一下SELDI技术在中国的推广需要多长时间?

何大澄教授:目前蛋白质组学和生命科学的发展非常之快,几乎每个月都会看到有新的技术或仪器被报道或推出,所以很难来预测SELDI在中国范围内的推广或者广泛的被应用会需要多长时间,但这个推广需要两方面的条件。{dy},SELDI有它自己的特色,也有它能发挥作用的地方,而迄今为止,这些作用并没有能够充分的发挥出来。要真正发挥出它的潜力,就需要更多的人了解SELDI技术适合解决什么问题,是什么样的一个工具,在哪些特定的目标下使用这项技术才能够更好发挥它的作用。第二,影响SELDI技术广泛应用的一个障碍是各个单位使用这项技术时的重复性不好。尤其在涉及临床应用方面,这实在是一个成败攸关的问题。但是这个重复性的不好并不是仪器或技术本身的问题,因为该仪器和技术的原理是非常单纯和明确的,并未引入复杂的影响因素。问题的产生往往是由于操作程序上,特别是清洗等过程的影响。稍有不同的操作条件可能影响到其选择性捕获的蛋白质种类的多少及其相对强度。而这正是该技术要提供的核心数据。所以操作程序的严格标准化,是推广这个技术尤其是推广这些技术在临床方面的应用最根本的关键所在。只有在操作上面实行标准化,{zh1}得到的结果才能有一个被公认的统一的标准。我们过去几年基本上每年举办研习班,主要就是针对这两个问题,但显然还需要更多的努力。

生物谷(Bioon.com):我们了解到您是高等院校蛋白质组学研究院院长,在您看来,蛋白质组学的研究在生命科学研究中处于一个什么样的地位?

何大澄教授:蛋白质组学是在分子生物学等现代生命科学发展的基础之上应运而生的。像分子生物学等学科过去的发展基本上是越分越细。人类基因组研究的兴起和巨大成就,以及随后出现的众多"组学"标志着现在终于有了一个丰富而坚实的基础可以综合了。这个综合并不是表示我们走的是一个与原来相反的方向,而是我们走上了一个全新的阶段。蛋白质组学的发展对于很多的学科会产生非常深刻的影响。我认为细胞生物学在细胞、组织和个体等几个层次中间是一个枢纽学科,而蛋白质组学的目标是力求从总揽的角度解释细胞里面所实现的生命现象,尤其是有多少种什么样的蛋白质在何时、何处、如何发挥作用。所以它对于细胞生物学的影响是最直接、最深刻的。所以我们说"蛋白质组学正在成为细胞生物学的重要基础"。同时,在影响了这个枢纽性的学科之后,其他的生命学科也无不受到影响。

何大澄教授:各种"组学"的兴起,代表了生命科学研究的新角度和新层次。个人认为在众多"组学"中,基因组是基础,蛋白质组是核心。由于蛋白质都是由基因编码出来的,所以基因组是一个基础。从生命的各种特性和生命的进化来说,是由基因组决定的,但是从具体的生命过程或生命活动机制来说,是通过蛋白质本身的功能和相互作用去完成的。我想很难说这两个学科中哪个更"重要",但与其他"组学"相比,这两个学科是最"基本"的,而且相互密不可分。如果说差别,基因组相对来说是比较稳定的,它的变动通常是随着长期的进化等过程而发生。但对于一个现实的具体生命活动,比如在细胞里面的活动或者细胞水平以上的活动,一个活跃变动的蛋白质组才能解释具体的这些工作原理。当然一个生命活动,不是任何一个单独的成分就可以完成的,不只是蛋白质,更不可能只是糖类或者脂类。研究这个动态的规律,对于了解生命过程、生命活动,或者将来有可能干预生命活动,都是最重要的一个部分。所以我想也许可以说,"动态和差异"是蛋白质组学研究的灵魂。

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