“化生”是气化学说的重要术语，是用于解释生物出现的，意思是很多生物最初是直接“气化生成”的。这种认识最早可以追溯到先秦，但以宋代最为xx学者称道。程朱之学即认为人类最初也是一步“气化生成”的，其他生物最初也自然是“化生”的。换言之，气化学说从来没有发展到进化学说。李时珍xx继承了这种思想。我们知道，这种思想和西方１９世纪中叶还比较盛行的“自然生成”说xx一致。巴斯德的xx实验最终摧毁了这种思想。达尔文的进化论也最终确立。“化生”虽然不把生命起源归功于上帝，但是根本没有解决生物如何出现、为什么有高级、低级之不同等问题。
下面是《本草纲目》中关于“化生”的比较典型的例子。
本草纲目 虫之三（化生类 31种）
人虱：（时珍曰）人物皆有虱，但形各不同。始由气化，而后乃遗卵出虮也。抱朴子云：头虱黑，着身变白；身虱白，着头变黑，所渐然也。又有虱癥、虱瘤诸方法，可见虱之为害非小。千金方云：有人啮虱在腹中，生长为癥，能毙人。……洪迈夷坚志云：临川有人颊生瘤，痒不可忍，唯以火炙。一医剖之，出虱无数，{zh1}出二大虱，一白一黑，顿愈，亦无瘢痕。……（洪钧按：纲目虫之二，本属卵生类）
蠐螬：（时珍曰）其状如蚕而大，身短节促，足长有毛。生树根及粪土中者，外黄内黑；生旧茅屋上者，外白内暗。皆湿热之气熏蒸而化，宋齐丘所谓“燥湿相遇，不母而生”是矣。久则羽化而去。（洪钧按：化生类{dy}种）
蚱蝉：颂曰：……本生土中，云是蜣螂所转，久而化成此虫，至夏登木而蜕。（发明）时珍曰：蝉乃土木余气所化，饮风吸露，其气清虚。故其主疗，皆一切风热之证。
本草纲目第46卷介部二 介之二（蚌蛤类29种）
牡蛎：释名（时珍曰）哈蚌之属，皆有胎生、卵生。独此化生，纯雄无雌，故得牡名。（洪钧按；前有藏器曰：天地万物皆有牝牡。唯蛎是咸水结成，块然不动，xxxx，何从而生？）
又，“湿生”是“化生”的一种形式，只是加上“湿”这个条件。
蟾蜍：集解：（时珍曰）蟾蜍锐头膰腹，促眉浊声，土形，有大如盘者。自然论云：蟾蜍吐生，掷粪自其口中出也。抱朴子云：蟾蜍千岁，头上有角，腹下丹书，名曰肉芝，能食山精。人得食之可仙。术家用以起雾祁雨，辟兵解缚。今有技者，聚蟾为戏，能听指使。物性有灵，于此可推。许氏说文谓三足者为蟾，而寇氏非之，固是；但龟、鳖皆有三足，则蟾之三足非怪也。若谓入药必用三足，则谬矣。……发明（时珍曰）蟾蜍，土之精也。上应月魄而性灵异，穴土食虫，又伏山精，制蜈蚣；故能入阳明经，退虚热，行湿气，杀虫匿，而为疳病廱疽诸疮要药。
蛤蟆：集解（时珍曰）蛤蟆亦能化鹑，出淮南子。
蚯蚓：集解（时珍曰）……孟夏始出，仲冬蛰结。雨则先出，晴则夜鸣。或云结时能化为百合也。
蛔虫：集解：（时珍曰）……凡一切癥瘕，久皆成虫……虫之变不可胜穷，要之皆以湿热为主。虫得木气乃生，得雨气乃化，岂非风木主热，雨泽主湿耶？故五行之中皆有虫。……
二．关于“龙”和“龙骨”
“龙”是最有中国文化特色的一种“动物”，李时珍相信它是“神物”，并用“九九阳数”说明其神圣。今天我们已经知道“龙”是自然界不存在的“动物”。“龙骨”则是多种动物的化石。其中包括恐龙化石。
龙：集解（时珍曰）……龙者，鳞虫之长。王符言其形有九似：头似驼，角似鹿，眼似兔，耳似牛，项似蛇，腹似蜃，鳞似鲤，爪似鹰，掌似虎，是也。其背有81鳞，具九九阳数。
龙骨：（时珍曰）龙骨，本经以为死龙，陶氏以为蜕骨，苏、寇诸说皆两疑之。窃谓龙，神物也，似无自死之理。然观苏氏所引斗死之龙，及左传云，豢龙氏醢龙以食；述异记云，汉和帝时大雨，龙堕宫中，帝命做羹赐群臣；博物志云，张华得龙肉酢，言得醋则生五色等说，是龙固有自死者矣。当以本经为正。
三．关于河豚、海豚
我们知道，河豚、海豚都是哺乳动物，李时珍的认识离真理只差一步。有关河豚还有下面的注解中涉及的问题。
河豚：集解（时珍曰）今吴越最多。状如蝌蚪，大者尺余，背色青白，有黄溇文，无鳞、无鳃、无胆，腹下白而不光。率以三头为一部。彼人春月甚珍贵之，尤重其腹腴，呼为西施乳……南人言，鱼之无鳞无鳃，无胆有声，目能眨者，皆有毒。河豚备此数者，故人畏之。……
注：此所谓河豚应该是东方鲀属（Fugu；far east puffers）鲀形目鲀科的1属。约有19种。通称河豚，又名吹吐鱼，艇鲅鱼，气泡鱼。一般体长在100—300毫米左右，大的可达630毫米以上。
现代动物分类学已经明确界定，河鲀与河豚实际上是不同纲的两类动物。河鲀是硬骨鱼纲鲀形目鲀总科鲀科鱼类，生活在河流入海段及近海；有些种类(如东方鲀属)的脏器(肝脏、生殖腺)和血液有剧毒(称“河鲀毒素”)，可作药用，加之其肉味鲜美，故具有捕杀加工食用的价值。而河豚则应是哺乳纲河豚总科河豚科(也称淡水豚科)动物，如白鳍豚，江豚(豚即猪，故江豚俗称“江猪”)等；它们在淡水中生活，脏器xx。海洋中，有人们熟知的海豚，也是水生哺乳动物，而非鱼类。
专家认为，在新闻媒体和出版物上，应当尽量多使用“河（鱼豕）”而少使用“河豚”，以使之逐步规范化。总有{yt}，“拼死吃河豚”这句熟语会被改为“拼死吃河（鱼豕）”。当然，由于历史的原因，“河豚”这个名称还会较长时间地流行于世。
海豚：集解（时珍曰）其状大如数百斤猪，形色青黑如鲶鱼，有两乳，有雌雄，类人。数枚同行，一浮以没，谓之拜风。
四．关于龟
龟曾经是占卜的灵物，汉代之前非常盛行，唐代官方废弃占龟。李时珍仍然相信神龟。
本草纲目第46卷介部二一 介之一（龟鳖类17种）
水龟：集解：（时珍曰）甲虫三百六十，而神龟为之长。龟形象离，其神在坎。上隆而文以法天，下平而理以法地。背阴向阳，蛇头龙颈。外骨内肉，肠属于首，能云任脉。……龟以春夏出蜇脱甲，秋冬藏六导引，故灵而多寿。
秦龟：集解（时珍曰）山中常龟，鹿喜食之。其大而可卜者，曰灵龟。年至百岁能变化者，曰筮龟。
五．关于金鱼
金鱼是中国古代通过人工选择培育的物种。李时珍时代，金鱼似乎还不像今天这样千姿百态。他也没有提出人工选择的概念。
六、关于金属
《纲目》记载了关于金属的许多感性知识，但理论把握很使人失望。
本草纲目第8卷金石部（金类28种）
金：释名：（时珍曰）按许慎说文云：五金黄为之长，久埋不生衣，百炼不轻，从革不违，生于土，故字左右注，象金在土中之形。……发明：（时珍曰）金乃西方之行，性能制木，故疗惊痫风热之病，而古方罕用。
银：发明：（好古曰）白银属肺。……（时珍曰）生银初煎出如缦理，乃其天真，故xx。融者投以少铜，则成丝纹金花，铜多则反败银，去铜则复还银，而初入少铜终不能出，作伪者又制以药石铅锡。……其入药亦是平肝镇怯之义。故太清服炼书言，银秉西方辛阴之神，结精为质，性刚戾，服之能伤肝，是也。
铜：释名：（时珍曰）铜与金同，故字从金、同也。集解（时珍曰）铜有赤铜、白铜、青铜。……人以炉甘石炼为黄铜，其色如金。砒石炼为白铜，杂锡炼为响铜。……发明（时珍曰）铜秉东方乙阴之气结成，性利，服之伤肾。既云伤肾，而又能接骨，何哉？
铅：集解：（时珍曰）铅生山穴石间，人夹油灯，入至数里，随矿脉上下曲折斫取之。其气毒人，若连月不出，则皮肤萎黄，腹胀不能食，多数致疾而死。……发明：（时珍曰）铅秉北方癸水之气，阴极之精，其体重实，其性濡滑，其色黑，内通于肾。故局方黑锡丹、宣明补真丹皆用之。得汞交感，即能治一切阴阳混乱，上盛下虚，气升不降，发为呕吐眩晕、噎膈反胃危笃诸疾，所谓镇坠之剂，有反正之功。但性带阴毒，不可多服，恐伤人心胃耳。……铅变化为胡粉、黄丹、密陀僧、铅白霜，其功皆与铅同。
锡：集解（时珍曰）锡出云南，衡州。许慎说文云：锡者，银铅之间也。土宿本草云：锡受太阴之气而生，二百年不动成砒，砒二百年而锡始生。锡秉阴气，故其质柔。二百年不动，遇太阳之气乃成银。今人置酒于新锡器内，浸渍日久或xx者，以砒能化锡，岁月尚近，便被采取，其中蕴毒故也。
铁：集解（时珍曰）铁皆取矿土炒成。……铁受太阳之气。始生之初，卤石产焉。一百五十年而成磁石，二百年孕而成铁，又二百年不经采炼而成铜，铜复化为白金，白金化为黄金，是铁与金银同一根源也。……发明：（时珍曰）铁于五金，色黑配水，而其性则制木，故痫疾宜之。素问治阳气太盛，病狂善怒者，用生铁落，正取伐木之意。日华子言其镇心安五脏。岂其然哉！本草载太清服食法，言服铁伤肺者，乃肝字之误。
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