由于种种原因，自发形成的家庭旅馆存在问题比较突出。主要表现在：（一）家庭旅馆普遍档次较低、特色不突出、服务不能规范。（二）有特色的家庭旅馆数量少，如何打造高品位、功能齐全，有一定规模的家庭旅馆品牌产品，仍有得进一步的探索和实践。（三）对家庭旅馆的管理、协调、疏导以及宣传推介仍有许多不足。（四）发展有特色家庭旅馆、受资金及配套设施制约。
1、卫生间。家庭旅馆一般位于农村，农民对于卫生间的卫生要求往往达不到游客的标准，需要进行改造，并加强卫生管理。例如，藏族的卫生间是传统的蹲式，没有冲水设备，粪便从二楼直接露天下落到一楼，在一楼自然堆积，难以满足游客对卫生状况的要求。在林芝家庭旅馆规划设计中，广东省旅游发展研究中心对其进行了改造，增加冲水和排污管道，使游客能够接受。
2、通水通电：一些村落的自来水管道尚未建成，往往用山溪水或井水，水质卫生得不到保证。家庭旅馆的建设首先要完善基础设施，铺设供水管道。
3、床铺。各地的床铺各不相同，我们认为没有必要统一，但是对于床铺的结实、平整、卫生、舒适四个方面不能马虎。睡在北方的炕上、睡在南方古镇的老式大床上都能够增加游客的兴奋感。在家庭旅馆规划建设中，我们提倡被褥用有地方特色的花布，在窗户和家具方面增强地方文化气息。
4、公共活动场所。家庭旅馆客人需要与居民交流，与共同住宿的游客交流。家庭旅馆往往也难以做到每个房间都有电视，所以需要有一个公共活动场所。这个场所一般与餐厅在一起。在阳朔和拉萨、丽江，这个公共场所是酒吧。在林芝的家庭旅馆，这个场所是二楼的大厅，旅游者可以与藏民一起用餐，看藏民打酥油茶、做糌粑，马上品尝酥油茶和糌粑，还可以一起看电视、打xx牌、下棋，交流旅游经历。
5、标准图则和审定标准。
一般群众对于如何改造出一个家庭旅馆没有经验，政府应给予一定的指导。例如，房间和床位的大小如何适应游客的习惯。标准图则的出台十分必要。在林芝家庭旅馆建设规划中，广东省旅游发展研究中心制定了三个标准图则，指导当地群众改造和新建家庭旅馆。对于申报营业的家庭旅馆，当地旅游主管部门也可以对照图则进行审定，确定其是否可以成为家庭旅馆协会的一员。
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