1.技术标准难题
农业物联网建设需要依赖大量的传感器监测传输数据，但我国目前在信息的获取、传感器与数据平台应用和人机交互接口等方面还没有出台统一的国家技术标准，厂家没有办法按照统一标准规模化生产，终端成本的选择成为制约物联网在农业中推广的重要因素。
2.多部门协同合作问题
农业物联网技术在农业上的应用是一个涉及面广泛的复杂的系统工程，农业物联网采集的信息广泛，需要气象、环境、检验等部门和政府、企业、农户等进行大量信息的传递、共享和分析。保证物联网在不同的环节都可以建立信息采集点，有效整合多部门的信息及功能是解决此问题的关键。
3.商业模式问题
目前，农业物联网应用的商业模式主要有3种：运营企业做的示范性项目，由运营企业买单;农业主管部门推动的项目，由农业主管部门买单;一些有需求的大型农场为自己的物联网应用买单。这3种模式都未能很好地解决成本高、产业链参与不够主动等问题。为此，更需要激励产业链各方参与者，构建更为合理的商业模式。
针对以上几个问题，我国正在建立传感器信息采集等国家标准、加大资金投入和政策支持。此外，物联网企业正加快技术支撑体系的建立，改变现在分割管理的模式，建立适应物联网新技术的现代行政管理模式，建立可以统筹各部门、信息传输通畅的现代行政管理体系。通过各方的努力，我国农业物联网的应用终将愈发完善。
